为了让水仙鳞茎在最后栽培后能够在很大程度上增大，这样可有更多花开出，要想达到这样的目的就需要对种球进行阉割手术。

这项手术的原理相似于一般植物的剥芽，集中养分，使主芽健壮的生长，第二年就可以得到一个硕大的鳞茎球了。水仙所具有的侧芽在鳞片之内包裹着，如果不将鳞片剖开就不能将侧芽去除。所以阉割技术有较大难度，操作的时候要仔细。在阉割的时候，先将侧芽着生的位置对准，将鳞茎盘用左手拇指和食指捏住，用右手拿刀进行手术，阉割刀要有大约1.5厘米宽，刀口在先端是回头形的；在阉割的时候，最好挖小口，如果将鳞茎盘和主芽误伤了，该球就没有用了，应该丢掉；另外如果发现有黑褐色斑驳存在于内部鳞片，也要丢掉。

这种阉割手术要求将全部的侧芽去掉，也不能损害到主芽和鳞茎盘，而且在主芽扁平叶面的两侧就是侧芽，这非常不好处理，在手术的时候要讲究泾渭分明。